O laboratoriji
Saradnici Laboratorije za bioinformatiku i računarsku hemiju (Laboratorija 180) primenjuju savremene bioinformatičke pristupe i metode računarske hemije za analizu biomolekula. Istraživanja u ovoj laboratoriji od njenog osnivanja zasnivaju se dominantno na primeni Metode Informacionih Spektara (ISM). Ovaj bioinformaticki metod je razvijen u Laboratoriji 180, a danas se koristi u vodećim naučnim institucijama i biotehnološkim kompanijama u svetu.
Dalji razvoj ISM-a doveo je do primene ove metode na male molekule (ISM for Small Molecules, ISM-SM), koja se zasniva na dalekosežnim interakcijama između proteina i liganda. U kombinaciji sa metodama koje analiziraju kratkosežne interakcije, kao što su molekulski doking i molekulska dinamika, istraživanja u Laboratoriji 180 usmerena su na in silico razvoj novih lekova i prenamenu postojećih za terapiju hroničnih i infektivnih bolesti.
Saradnici Laboratorije 180 razvijaju algoritme mašinskog učenja za analizu biomolekula, kao i proteinskih i genomskih podataka relevantnih za razvoj terapija i prevenciju neinfektivnih bolesti. U tom okviru razvijen je niz bioinformatičkih alata zasnovanih na fizičko-hemijskim principima i mašinskom učenju, uključujući EpiMut i GOMLEns, koji su pokazali vrhunske performanse u funkcionalnoj anotaciji varijanti u epigenetskim regulatorima i predikciji proteinskih funkcija, sa primenom u biomedicinskim istraživanjima i preciznoj terapiji.
Takođe, metode računarske hemije primenjuju se i u istraživanju pesticida, uključujući molekulski doking, molekulsku dinamiku i ADMET analize, sa ciljem procene njihove toksičnosti, selektivnosti i potencijalne prenamene u neurofarmakologiji.